每台陶氏纳滤膜系统应配置预处理滤芯过滤器，其孔径的要求为至少小于10m，它对陶氏纳滤膜和高压泵起保护作用，防止可能存在的悬浮颗粒造成的破坏，通常它是预处理的后的一道关卡，推荐使用孔径小于等于5m，预处理做得越好，陶氏纳滤膜所需的清洗次数就越少。
当陶氏纳滤膜浓水中的硅浓度超过理论溶解度时，建议滤芯孔径选择 1m，以降低硅与铁和铝胶体的相互作用。
陶氏纳滤膜预处理的滤芯式滤器要按制造商的建议选择过滤流量，在压降超过允许范围前及时更换，但不要超过三个月，由于清洗滤芯的效率较低并存在更高的生物污染的危险性，陶氏纳滤膜系统不推荐选用可清洗滤芯式滤器。滤芯材料需要是非降解的合成材料，如尼龙或聚丙烯，还应装有压力表指示压降，以便表示截留污染物的数量。
定期检查用过的陶氏纳滤膜预处理滤芯可帮助系统操作者获得污染危险警报和需要清洗的有用信息。如果滤器压差增加过快，表示陶氏纳滤膜预处理过程或水源可能出现问题，在采取对策之前，预处理系统仅提供某种程度地短暂保护。
如果滤芯每1~3个月就得更换的话，说明预处理部分存在某些问题，过滤器不是用来过滤大量杂质的设备，如果设计选择不当的话，不仅会产生昂贵的更换费用，而且还会因为某些物质容易穿透滤芯而导致陶氏纳滤膜系统过早的故障。
