陶氏膜的微生物污染在所有污染问题中是比较难处理的，所以在系统投入运行前应该做好检查，避免出现任何与微生物活动有关的问题。陶氏膜系统微生物防治的启动前检查内容如下：
1、若中间使用敞开式的容器时，需在该敞开式的容器及其下游进行杀菌。
2、若中间使用封闭式的容器时，陶氏膜系统的通气或通风系统须有防止细菌的设备，如呼吸过滤器。
3、需避免较长的盲管，当无法避免时，需定期消毒杀菌。
4、避免设置像砂滤或保安过滤器这样具有大面积的备用设备，若无法避免，需安装排放系统，用于排放系统经杀菌之后所残留的杀菌剂和该备用设备投运前的冲洗排放。
5、根据原水微生物负荷和陶氏膜系统特点，进行预处理的定期杀菌。
6、建议用含足够量氯的水反冲洗陶氏膜预处理系统。一般而言，用于杀菌、冲洗和配置清洗溶液的水应不含微生物。
7、组成前处理系统的管线、接头、过滤器和贮罐应不透光，以免促进生物的生长。
8、所有管线、水箱、接头、贮罐、过滤设备及整个前处理系统在每次开机前、开机后以及陶氏膜系统连续操作期间皆需定期杀菌。除反渗透膜部位外，可采取重点加氯法，此时，需保护ro反渗透系统免遭氯的接触，如使用盲板法兰将反渗透膜部分与其他系统隔离，为此还应在靠近法兰下方安装排放装置。
9、在陶氏膜系统现场需有足够用于保存、清洗及杀菌的化学药品。
